デフォルトで生成されるサムネイルのサイズは長辺が128pxに固定されています。
本体のファイルを変更している方もいるようですが、これは Yurikoさんが WordPress Japan フォーラムへ投稿 した簡単なプラグインで変更できます。これをプラグインのファイルにした物が見つからなかったのでこちらに置いときます（GPLってことでいいですよね？＞Yurikoさん）：
このプラグインでは長辺のサイズが160pxになってます。変更するにはこのファイルをテキストエディタで開いて「160」を好きな大きさに変更してください。
ありがとう、Yuriko さん！